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Vinculos Contacto

 

Dr Victor CIfuentes

 

Profesor Titular
Decano de la Facultad de Ciencias

Teléfono: (56-2) 2978 7346
E-mail: vcifuentes@uchile.cl
Area de investigación: Genética de Levaduras/Microbiología
Video acerca de mi investigación:
http://ciencias.uchile.cl/ciencias/VCIFUENTES.swf

 


Genética, Biodiversidad y Biotecnología de levaduras carotenogénicas. Se estudia los mecanismos de regulación de la expresión de los genes que controlan la ruta de biosíntesis de carotenoides en Xanthophyllomyces dendrorhous. Se determinan las relaciones existentes entre cambios estructurales del genoma de levaduras, cambios en la fisiología del gen como un mecanismo de regulación de la expresión génica. Para ello se considera al genoma de las levaduras como un sistema dinámico que tiene la capacidad de responder a factores externos de una manera plástica, lo que puede llegar a tener grandes consecuencias para el organismo en cuestión. Así, podría existir una correlación entre cambios en la organización genómica estructural y cambios en la expresión génica.
Biodiversidad de levaduras carotenogénicas: Se estudia la distribución y características genéticas de levaduras productoras de carotenoides en bosques de regiones frías y la antártica.


Proyectos

2014-2017: Catabolite repression as a mechanism for regulating the biosynthesis of the secondary metabolites: carotenoids and mycosporines, in Xanthophyllomyces dendrorhous. Fondecyt 1140504. IP: Dr. Victor Cifuentes.

2013-2016: Genetic-physiological adaptation mechanisms of yeasts to Antarctic environmental conditions. FONDECYT 1130333 IP: Dr. Marcelo Baeza.

2013-2016. Co-Investigador Proyecto FONDECYT 1130333 Genetic-physiological adaptation mechanisms of yeasts to Antarctic environmental conditions. PI: Dr. Marcelo Baeza.

2013-2015. Co-Investigador Proyecto INACH RG_07-12 Analysis and enhancement of the production of metabolites of bitechnological interest in Antarctic Xanthophyllomyces dendrorhous yeast strains. PI: Dra. Jennifer Alcaíno.

2013-2014. Investigador Asociado Proyecto U-Redes “Red de Ingeniería Metabólica en Microorganismos y Plantas”, Programa U-REDES  VID 2012 PI: Dr. Ricardo Cabrera.


Publicaciones

 

Alcaíno J, Romero I, Niklitschek M, Sepúlveda D, Rojas MC, Baeza M, Cifuentes V. 2014. Functional characterization of the Xanthophyllomyces dendrorhous farnesyl pyrophosphate synthase and geranylgeranyl pyrophosphate synthase encoding genes that are involved in the synthesis of isoprenoid precursors. PLoS ONE 9(5): e96626.

Contreras G, Barahona S, Rojas MC, Baeza M, Cifuentes M, Alcaíno J. 2013. Increase in the astaxanthin synthase gene (crtS) dose by in vivo DNA fragment assembly in Xanthophyllomyces dendrorhous. BMC Biotechnol. 13:84.

Carrasco M, Rozas J, Barahona S, Alcaíno J, Cifuentes V, Baeza M. 2012. Diversity and extracellular enzymatic activities of yeasts isolated from King George Island, the sub-Antarctic region. BMC Microbiolology 12:251.

Loto I, Gutierrez MS, Barahona S, Sepulveda D, Martinez-Moya P, Baeza M, Cifuentes V, Alcaíno J. 2012. Enhancement of carotenoid production by disrupting the C22-sterol desaturase gene (CYP61) in Xanthophyllomyces dendrorhous. BMC Microbiology 12:235.

Alcai´no J, Fuentealba M, Cabrera R, Baeza M, Cifuentes V. 2012. Modeling the Interfacial Interactions between CrtS and CrtR from Xanthophyllomyces dendrorhous, a P450 System Involved in Astaxanthin Production. J Agric Food Chem. 60: 8640-8647.

Baeza M, Bravo N, Sanhueza M, Flores O, Villarreal P, Cifuentes V. 2012. Molecular characterization of totiviruses in Xanthophyllomyces dendrorhous. Virology Journal 9 , art. no. 140.

Baeza M, Fernández-Lobato M, Cifuentes V. 2012. Isolation and characterization of extrachromosomal double-stranded RNA elements in Xanthophyllomyces dendrorhous. Methods in Molecular Biology 898: 195-205.

Niklitschek M, Baeza M, Fernández-Lobato M, Cifuentes V. 2012. Generation of astaxanthin mutants in Xanthophyllomyces dendrorhous using a double recombination method based on hygromycin resistance. Methods in Molecular Biology 898: 219-234.
Urzúa B, Ortega-Pinto A, Farias DA, Franco E, Morales-Bozo I, Moncada G, Escobar-Pezoa N, Cifuentes, V. 2012. A multidisciplinary approach for the diagnosis of hypocalcified amelogenesis imperfecta in two Chilean families. Acta Odontologica Scandinavica 70:  7-14.

Contreras G, Barahona S, Baeza M, Cifuentes V, Alcaíno J. 2012. El color del salmón y las levaduras antárticas. Boletín Antártico 31: 12-13.

Marcoleta A, Niklitschek M, Wozniak A, Lozano C, Alcaíno J, Baeza M, Cifuentes V. 2011.  Carbon source-dependent transcriptional regulation of the astaxanthin biosynthesis pathway in Xanthophyllomyces dendrorhous. BMC Microbiology 11: 190.

Martínez-Moya P, Watt SA, Niehaus K,  Alcaíno J, Baeza M, Cifuentes V. 2011. Proteome analysis of carotenogenic yeast Xanthophyllomyces dendrorhous. BMC Microbiology 11: 131.

Wozniak  A, Lozano C, Barahona S, Niklitschek M, Marcoleta A, Alcaíno J, Sepúlveda D,  Baeza M, Cifuentes V. 2011. Differential carotenoid production and gene expression in Xanthophyllomyces dendrorhous grown in a non-fermentable carbon source. FEMS Yeast Research 11:252.

Urzúa B, Ortega-Pinto A, Morales-Bozo I, Rojas-Alcayaga G Cifuentes V. 2011. Defining a new candidate gene for amelogenesis imperfecta: From molecular genetics to biochemistry. Biochemical Genetics 49: 104-121

Baeza M, Flores O, Carrasco M, Rozas JM, Oviedo V, Barahona S, Cifuentes V. 2010. The inter-generic fungicidal activity of Xanthophyllomyces dendrorhous. Journal of Microbiology 48: 822-828

Baeza M, Sanhueza M, Flores O, Oviedo V, Libkind D, Cifuentes V. 2009. Polymorphism of viral dsRNA in Xanthophyllomyces dendrorhous strains isolated from different geographic áreas. Virology Journal 6: 160.

Baeza M, Retamales P, Sepúlveda D, Lodato P, Jiménez A, Cifuentes V. 2009. Isolation, characterization and long term preservation of mutant strains of Xanthophyllomyces dendrorhous. Journal of Basic Microbiology 49: 135-141.

Alcaíno J, Barahona S, Carmona M, Lozano C, Marcoleta A, Niklitschek M, Sepúlveda D, Baeza M, Cifuentes V. 2008. Cloning of the cytochrome p450 reductase (crtR) gene and its involvement in the astaxanthin biosynthesis of Xanthophyllomyces dendrorhous. BMC Microbiology 8:169.

Niklitschek M, Alcaíno J, Barahona S, Sepúlveda D, Lozano C, Carmona M, Marcoleta A, Martínez C, Lodato P, Baeza M, Cifuentes V. 2008. Genomic organization of the structural genes controlling the astaxanthin biosynthesis pathway of Xanthophyllomyces dendrorhous. Biological Research 41: 93.

Baeza ME, Sanhueza MA, Cifuentes VH. 2008. Occurrence of killer yeast strains in industrial and clinical yeast isolates. Biological Research 41: 173-182

Urzua B, Hermosilla G, Gamonal J, Morales-Bozo I, Canals M, Barahona S, Coccola C, Cifuentes V. 2008. Yeast diversity in the oral microbiota of subjects with periodontitis: Candida albicans and Candida dubliniensis colonize the periodontal pockets. Medical Mycology 46: 783-793.


Publicaciones (anterior al año 2006)

Lodato P, Alcaíno J, Barahona S, Niklitschek M, Carmona M, Wozniak A, Baeza M, Jiménez A, Cifuentes V. 2007. Expression of the carotenoid biosynthesis genes in Xanthophyllomyces dendrorhous. Biological Research 40:73.

Lodato P, Alcaíno J, Barahona S, Retamales P, Jiménez A, Cifuentes V. 2004. Study of the expression of carotenoid biosynthesis genes in wild-type and deregulated strains of Xanthophyllomyces dendrorhous (Ex.: Phaffia rhodozyma). Biological Research 37: 83.

Lodato P, Alcaíno J, Barahona S, Retamales P, Cifuentes V. 2003. Alternative splicing of transcripts from crtI and crtYB genes of Xantophyllomyces dendrorhous. Applied Environmental Microbiology 8: 4676.


Patentes

Alcaíno J y Cifuentes V. 2008. CL1699-2008. “Uso de gen en la síntesis de astaxantina”. Patente presentada al Depto. de Propiedad Industrial (DPI) del Ministerio de Economía. También esta Patente está en etapa de presentación en Argentina. Esta es la 1º Patente presentada al Patent Cooperation Treaty (PCT) en Chile a través de INAPI el 2 de Junio de 2009 con el N° 0001. Número de Solicitud Internacional: PCT/CL 2009/000001. La solicitud posteriormente se presentó en Japón y Europa (que incluye a los países: Alemania, Austria, Bélgica, Bulgaria, Chipre, Dinamarca, Eslovenia, España, Estonia, Finlandia, Francia, Grecia, Holanda, Hungría, Irlanda, Italia, Liechtenstein, Luxemburgo, Mónaco, Portugal, Reino Unido, República Checa, República Eslovaca, Rumania, Suecia, Suiza y Turquía, además de los siguientes estados Albania, Latvia, Lituania y Macedonia).


Docencia

Pregrado
Curso de Genética y Taller de Ingeniería Genética (Coordinador)
Profesor Invitado: Taller de Bioreactores (Colaborador)

Postgrado
Genética y Biotecnología de levaduras y hongos  filamentosos (Coordinador)
Biología Molecular (Colaborador)

Extensión
Diplomado de Biología Molecular y Biotecnología (Colaborador)