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Vinculos Contacto

 

Dr Jennifer Alcaíno Gorman

 

Profesor Asistente
Doctor en Ciencias con mención en Microbiología, Universidad de Chile. 2009.

Teléfono: (56-2) 2978 7312
E-mail: jalcainog@u.uchile.cl
Línea de Investigación: Genética de Levaduras/Microbiología
Video acerca mi investigación: http://ciencias.uchile.cl/ciencias/ciencia_para_todos_jalcaino_video.html.


 

Estudiamos la organización genómica y la regulación de la expresión de genes que controlan la biosíntesis de isoprenoides en la levadura Xanthophyllomyces dendrorhous, además de genes involucrados en sistemas P450. Las enzimas citocromo P450 monooxigenasas catalizan una gran diversidad de reacciones involucradas en el metabolismo secundario, de algunos compuestos escenciales y de xenobióticos en todos los organismos. X. dendrorhous es el único organismo, que se ha descrito hasta la fecha, que sintetiza el carotenoide astaxantina desde beta-caroteno por un enzima P450. Además hemos encontrado otros doce genes de P450s en el genoma de la levadura: dos de ellos participarían en la síntesis de ergosterol. Hemos visto que el ergosterol estaría involucrado en la regulación de la expresión de varios genes, particularmente aquellos involucrados en la síntesis de precursores de los isoprenoides. Adicionalmente estudiamos aislados de X. dendrorhous que hemos obtenido desde muestras de tierra del territorio Antártico Chileno, que se caracterizan por producir naturalmente altos niveles de astaxantina.


Proyectos

2014-2017: Catabolite repression as a mechanism for regulating the biosynthesis of the secondary metabolites: carotenoids and mycosporines, in Xanthophyllomyces dendrorhous. Fondecyt 1140504. IP: Dr. Victor Cifuentes.

2013-2014: Red de Ingeniería Metabólica en Microorganismos y Plantas. Proyecto U-Redes VID 2012. IP: Dr. Ricardo Cabrera.

2013: Equipo de cristalización High-Throughput de proteínas. FONDEQUIP EM120208. IP: Dr. Ricardo Cabrera.

2013-2016: Genetic-physiological adaptation mechanisms of yeasts to Antarctic environmental conditions. FONDECYT 1130333 IP: Dr. Marcelo Baeza.

2011-2013: Molecular characterization of Xanthophyllomyces dendrorhous likely strains isolated from the Chilean Antarctica and metabolite with biotechnological potential production analysis. INACH M_01-11. (IP: Srta. Gabriela Contreras, alumna Magister).

 


Publicaciones

 

Alcaíno J, Romero I, Niklitschek M, Sepúlveda D, Rojas MC, Baeza M, Cifuentes V. 2014. Functional characterization of the Xanthophyllomyces dendrorhous farnesyl pyrophosphate synthase and geranylgeranyl pyrophosphate synthase encoding genes that are involved in the synthesis of isoprenoid precursors. PLoS ONE 9(5): e96626.

Contreras G, Barahona S, Rojas MC, Baeza M, Cifuentes M, Alcaíno J. 2013. Increase in the astaxanthin synthase gene (crtS) dose by in vivo DNA fragment assembly in Xanthophyllomyces dendrorhous. BMC Biotechnol. 13:84.

Carrasco M, Rozas J, Barahona S, Alcaíno J, Cifuentes V, Baeza M. 2012. Diversity and extracellular enzymatic activities of yeasts isolated from King George Island, the sub-Antarctic region. BMC Microbiology 12:251.

Loto I, Gutierrez MS, Barahona S, Sepulveda D, Martinez-Moya P, Baeza M, Cifuentes V, Alcaíno J. 2012. Enhancement of carotenoid production by disrupting the C22-sterol desaturase gene (CYP61) in Xanthophyllomyces dendrorhous. BMC Microbiolology 12:235.

Alcaíno J, Fuentealba M, Cabrera R, Baeza M, Cifuentes V. 2012. Modeling the Interfacial Interactions between CrtS and CrtR from Xanthophyllomyces dendrorhous, a P450 System Involved in Astaxanthin Production. J Agric Food Chem. 60(35):8640-8647.

Contreras G, Barahona S, Baeza M, Cifuentes V, Alcaíno J. 2012. El color del salmón y las levaduras antárticas. Boletín Antártico 31: 12-13.

Marcoleta A, Niklitschek M, Wozniak A, Lozano C, Alcaíno J, Baeza M, Cifuentes V. 2011.  Carbon source-dependent transcriptional regulation of the astaxanthin biosynthesis pathway in Xanthophyllomyces dendrorhous. BMC Microbiology 11: 190.

Martínez-Moya P, Watt SA, Niehaus K,  Alcaíno J, Baeza M, Cifuentes V. 2011. Proteome analysis of carotenogenic yeast Xanthophyllomyces dendrorhous. BMC Microbiology 11:131.

Wozniak  A, Lozano C, Barahona S, Niklitschek M, Marcoleta A, Alcaíno J, Sepúlveda D,  Baeza M, Cifuentes V. 2010. Differential carotenoid production and gene expression in Xanthophyllomyces dendrorhous grown in a non-fermentable carbon source. FEMS Yeast Research. 11:252.

Alcaíno J, Barahona S, Carmona M, Lozano C, Marcoleta A, Niklitschek M, Sepúlveda D, Baeza M, Cifuentes V. 2008. Cloning of the cytochrome p450 reductase (crtR) gene and its involvement in the astaxanthin biosynthesis of Xanthophyllomyces dendrorhous. BMC Microbiology 8:169.

Niklitschek M, Alcaíno J, Barahona S, Sepúlveda D, Lozano C, Carmona M, Marcoleta A, Martínez C, Lodato P, Baeza M, Cifuentes V. 2008. Genomic organization of the structural genes controlling the astaxanthin biosynthesis pathway of Xanthophyllomyces dendrorhous. Biological Research. 41:93.

Lodato P, Alcaíno J, Barahona S, Niklitschek M, Carmona M, Wozniak A, Baeza M, Jiménez A, Cifuentes V. 2007. Expression of the carotenoid biosynthesis genes in Xanthophyllomyces dendrorhous. Biological Research. 40:73.


Publicaciones seleccionadas (anterior al año 2006)

Lodato P, Alcaíno J, Barahona S, Retamales P, Jiménez A, Cifuentes V. 2004. Study of the expression of carotenoid biosynthesis genes in wild-type and deregulated strains of Xanthophyllomyces dendrorhous (Ex.: Phaffia rhodozyma). Biolical Research 37: 83.

Lodato P, Alcaíno J, Barahona S, Retamales P, Cifuentes V. 2003. Alternative splicing of transcripts from crtI and crtYB genes of Xantophyllomyces dendrorhous. Applied and Environmental Microbiology 8: 4676.


Patentes

Alcaíno J y Cifuentes V. 2008. CL1699-2008. “Uso de gen en la síntesis de astaxantina”. Patente presentada al Depto. de Propiedad Industrial (DPI) del Ministerio de Economía. También esta Patente está en etapa de presentación en Argentina. Esta es la 1º Patente presentada al Patent Cooperation Treaty (PCT) en Chile a través de INAPI el 2 de Junio de 2009 con el N° 0001. Número de Solicitud Internacional: PCT/CL 2009/000001. La solicitud posteriormente se presentó en Japón y Europa (que incluye a los países: Alemania, Austria, Bélgica, Bulgaria, Chipre, Dinamarca, Eslovenia, España, Estonia, Finlandia, Francia, Grecia, Holanda, Hungría, Irlanda, Italia, Liechtenstein, Luxemburgo, Mónaco, Portugal, Reino Unido, República Checa, República Eslovaca, Rumania, Suecia, Suiza y Turquía, además de los siguientes estados Albania, Latvia, Lituania y Macedonia).


Docencia

Postgrado
Profesor Colaborador: Genética y Biotecnología de levaduras y hongos  filamentosos (Colaborador).
Biología Celular y Genética aplicadas a las estructuras orales (Colaborador, Facultad de Odontología)

Pregado
Taller de Ingeniería Genética (Coordinador)
Curso de Genética y Electivo de Estrategias genéticas y moleculares en la mejora de levaduras para su uso industrial (Colaborador).
Taller de Bioreactores y Electivo de Técnicas moleculares para microbiología ambiental (Colaborador).

Extensión
Diplomado de Biología Molecular y Biotecnología (Coordinador)